قامت مؤسسة حرية الفكر و التعبير برفع دعوتين قضائيتين للطعن على قرار فصل كل من أحمد حسن أحمد محمد الطالب بالفرقة الثانية بكلية الهندسة بالجامعة الألمانية ، والطالب عبد الحميد أبو زيد عبد الحميد الطالب بالفرقة الثالثة بكلية الهندسة بالجامعة الألمانية، لوقف تنفيذ قرار فصلهم لمدة أسبوعين ، الصادر من مجلس الجامعة يوم 28 فبراير 2012،و حملت الدعاوى أرقام 26879 و 26896 لسنة 66 ، أمام محكمة القضاء الإداري ، وطالبت الدعاوى بوقف تنفيذ قرار مجلس الجامعة الألمانية بفصل الطلاب المذكورين لمدة أسبوعين تبدأ من 29 فبراير 2012 و تنتهي في 14 مارس 2012